서버의 문제가 아닙니다. 파일을 다운로드 하는 디스크의 파일시스템이 문제입니다. FAT32를 사용하고 계신것 같은데 그렇다면 파일 하나의 크기가 4GB를 넘지 못하기 때문에 당연히 오류가 발생합니다.
NTFS와 같이 대용량 파일을 관리할 수 있는 디스크에 다운로드를 해 주세요.

NTFS사용하고 있습니다.

IPC 같은 경우에는 잘 받았는데,

유독 ideneb 1.3만 그러네요...

01_OSX_for_Hackintosh/10.5.X_Leopard/iDeneb_v1.3_10.5.5
위 경로에 있는 것을 제가 FTP로 다운로드를 해 봤는데 말씀하신 문제가 재현되지 않습니다.
아무래도 다른 문제가 있는 듯 합니다.
전송모드가 ASCII 모드로 되어 있는 것은 아닌지요? 그렇다면 binary 모드로 다운로드 해 보세요.
그리고 가능하시다면 파일질라를 이용해서 다운로드 해 보시기 바랍니다.
바이너리/파일질러로 하더라도 문제가 생긴다면 다시 리플을 달아 주세요.

물론 파일질라 사용하고 있습니다. 전송모드도 바이너리도 하고 시도해보았습니다만...

계속 2기가 이상의 파일은 이어받기가 안되다고 나오네요......

이어받기의 경우 2GB 이상의 경우 지원이 안되는 것이 맞습니다. 한번에 받으면 이상없이 전송이 됩니다.
ftp 데몬으로 사용하고 있는 pureftpd 자체의 한계인 것 같습니다.

음.. 맥에서 하니깐 한큐에 다운이 되더라고요.
윈에서 할때만 계속 2기가 즈음에서 멈추는 현상이.. ^^